ojo, IE sólo bloquea JS de forma predeterminada cuando el mismo archivo es abierto desde la shell de windows (a entender de forma local con file:// en el navegador de archivo).
en tal caso, lo ideal es que instales un web server local, sea Apache o el IIS (recomiendo apache, o paquetes todo en uno como XAMPP)
Cuando ejecutes el sitio desde
http://localhost como es debido, usando el servidor web local, IE no bloqueará los script, claro, esto no evita que el usuario desactive JS completamente