Prueba crear tu consulta de esta forma ..
$query="SELECT DISTINCT DATE_FORMAT( R.FECHA, '%d/%m/%Y' ) AS FECHA, INV.SERIE, IFNULL( R.COSTO_REPARACION, 0 ) AS COSTO, R.DESCRIPCION
FROM INVENTARIO INV, REPARACION R, ALUMNO_SERIE AX
WHERE R.SERIE = INV.SERIE
AND (SELECT DATE_FORMAT( R.FECHA, '%Y' )) = '$year'
AND AX.SERIE = R.SERIE
AND AX.CODIGO_ESCUELA = '$escuela'
ORDER BY INV.SERIE ASC";
$result=mysqli_query($con,$query);//$$con es la conexión..
$n="";
$numfilas=mysqli_num_rows($result);
if ($numfilas>0){
echo '<table cellpadding="0" cellspacing="0" width="100%" border="1" bgcolor="#dff0f2">';
echo '<tr><td align="center"> N0. </td><td align="center">Fecha</td><td>Serie</td><td align="center">Costo</td><td align="center">Descripción</td></tr>Resultado de La Consulta';
for ($i = 0; $i < $numfilas; $i++){
$fila = mysqli_fetch_array($result);
$n+=1;
echo '<tr><td>'.$n.'</td><td>'.$fila['FECHA'].'</td><td>'.$fila['SERIE'].'</td><td align="right">'.number_format($fila['COSTO'], 2, ".", ",").'</td><td align="left">'.$fila['DESCRIPCION'].'</td></tr>';
}mysqli_free_result($result);
}
else{
echo 'No hay Resultados';
}
}
Resultado de La Consulta
N0. Fecha Serie de Costo L Descripción
1 23/09/2012 SCH217023B100 8,745.00 PROBANDO PARA EL REPORTE