Multi upload de imagenes (logica)

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Pues a menos que ese "registro de comercio" no se vuelva a usar o sólo se trate como información tipo log (registro histórico) debes tener un ID.

Ahora, un form no "crea" un registro, un form captura datos para pasarlos a algún código que los procese.

Hay quien decide almacenar el nombre de las imágenes en una tabla, obviamente ligando dicha tabla por el id del registro principal, en este caso, el id del comercio registrado. En estos casos, además se requiere que las imágenes se renombren para que su nombre de archivo no se repita.

Otra alternativa es una vez registrado el objeto (el comercio en tu caso) y teniendo su id, crear una carpeta con dicho id y colocando ahí todas las imágenes que hayan subido.

Y otra alternativa más que no se suele recomendar mucho es guardar las imágenes en la base de datos directamente, con campos de tipo blob.