Como bien te dijo tu colega, podés hacer un popup con javascript.
Desde mi punto de vista, la mejor ubicación para un código en JS es anter del cierre de la etiqueta </body>, así tu código se ejecutará después de que cargue toda la página. También podrías hacerlo en el head y utilizar window.onload pero a mi gusto es mejor la primer manera.
Para introducir el javascript, simplemente pones las etiquetas por fuera del bloque de código PHP. Recuerda que en un documento con extensión PHP, las etiquetas HTML, JS y todas las que sean interpretadas directamente por el navegador, se pueden poner como si estuvieras trabajando sobre un document HTML común ya que al pasar por el servidor, volverán "formateadas" como HTML estandar. Ejemplo:
Código PHP:
<?php
// Bloque de código PHP
?>
<script type="text/javascript">
alert( "Mi popup" );
</script><!-- Antes del cierre de la etiqueta body-->
</body>
<?php
// Continua el PHP
?>