Escaneo Codigo de Barras en PHP y ejecuta procesos

[Dalam]

Como dice GatorV son conjeturas, pero si los datos no varian mucho en poco tiempo, puedes instalar un servidor en el ordenador del escaner en modo espejo y luego que actualice los datos del servidor principal poco a poco.
Pero sin mas datos de como es el sistema, nadie podra darte una solucion, pues son muchos los factores que intervienen.
Por ponerte mas ejemplos, aunque tengas indexadas las tablas, si en las consultas no sigues los patrones adecuados, puede llegar a ser igual de lento que sin indexar.