Quiero realizar una consulta que reanude despues del último registro impreso

[Onedy]

Existen muchas formas de hacer algo, pero no todas son eficientes. Por ejemplo, no debes hacer una consulta a base de datos por cada dos datos. Haz una para todos.
Se me ocurre cómo hacer lo que buscas con estas dos funciones:

Código PHP:

//$elementos=array(array('nota10'),array('nota9'),array('nota8'),array('nota7'),array('nota6'),array('nota5'));
//guardamos todos las entradas recuperadas de la base de datos en un array
$elementos=array();
while($fila = mysql_fetch_row($result)) $elementos[]=$fila; //no uso $fila como array porque el último elemento va a ser un FALSE
 
//primera funcion que se encarga de hacer la estructura del <ul> main
function primerNivel($elementos){
    $cursor=1; //inicializamos el cursor que va a recorrer el array
    $tamano=count($elementos); //el tamaño del array
    $html='';
    if($tamano>0){ //procedemos si hay elementos, si no hay, no hacemos nada
        $html.='<ul class="main">'; //empezamos el main
        for($i=0;$i<ceil($tamano/2);$i++){ //hacemos solo la mitad de ciclos porque imprimimos los valores de 2 en 2
            $html.='<li>';
            $html.=segundoNivel($elementos, $cursor); //aquí llamamos a la funcion que genera el segundo <ul>
            $html.='</li>'; //cerramos li
        }
        $html.='</ul>'; //cerramos el <ul> main
    }
    return $html;
}
 
//segunda funcion que hace la estructura del <ul> items
function segundoNivel($elementos, &$cursor){
    $html='<ul class="items left clearfix">'; //empezamos el <ul> items
    $html.='<li>'.$elementos[$cursor][0].'</li>'; //imprimimos el primer elemento del par
    if(isset($elementos[$cursor+1])) $html.='<li>'.$elementos[$cursor+1][0].'</li>'; //aquí es posible que no tengamos segundo elemento cuando se trate del último par de valores
    $html.='</ul>'; //cerramos el <ul>
    $cursor+=2; //incrementamos el cursor en 2
    return $html;
}
//se usa así:
echo primerNivel($elementos);