js dentro de js

[LastN]

Hola a todos
Mi duda es la siguiente. Como podria relacionar un fichero js con otro a modo de referencia?. Me interesa separar cierta funcionalidad a nivel lógico en ficheros distintos, pero dado que la relacion entre el HTML y el script se especifica dentro de la etiquieta HTML <script>, esta no puede ser portada tal cual al js.

Espero haber sido claro.
Gracias de antemano.