Problema sencillo que no veo

[loncho_rojas]

puedes hacer un var_dump de tu array, de por ahi tienes un problema con los número, tal vez el campo no se llame ID o cosas similares, porque probé tu script y lo hace bien en mi caso..

var_dump(implode(',', $numeros));

Aunque si tienes la tabla con un campo relacionado, en este caso USUARIO, deberías solamente usar un JOIN o INNER JOIN, me parece, no conozco la estructura de tu tabla.