Buenas,
no, no es que siempre meta las cosas en una capa. Es que el tag div sirve para crear capas además de para alinear un párrafo.
una etiqueta div por sí sola no es una capa. Lo es sólo si se le espicifica un style con propiedades de capa. Si no, no define otra cosa que un bloque con alineación.
Si no recuerdo mal los tag <center> están llamados a desaparecer (si es que no han desaparecido yá de las especificaciones) y es substituído por el tag <div align="center"> o left o right
Eso sí, o bien usas div para definir una capa o bien para definir una alineación. No sirve usar ambos parámetros dentro del mismo div.
Así si quisieras una capa centrada habrías de pedirle
<div align="center">
<div style="position:absolute; width:200">
Aquí los contenidos
</div>
</div>
Eso sería correcto.
En cambio esto
<div align="center" style="position:absolute; width:200">
no te centraría la capa