Ubuntu se come mi disco duro?

[drdsnk]

Hola,
tengo un ordenador con Ubuntu 12.04 LTS que lo uso solo para virtualizar con VirtualBOX. Ha estado meses funcionando sin problemas hasta que he tenido que reiniciar Ubuntu y no entraba en modo gráfico con lo que VBox tampoco funcionaba. Liberando un poco de espacio con "sudo apt-get clean" he conseguido iniciar el modo gráfico y una vez dentro de el la máquina virtual no funcionaba porque el fichero de configuración estaba corrupto (había pasado a tamaño 0) así que usando el backup si que me ha funcionado.
El tamaño de los discos en la máquina virtual es fijo así que no habrán variado.

Actualmente funciona pero no entiendo porque casi no queda espacio en disco (ahora mismo el comando df me marca disponible en /dev/sda1 que es el que se llena solo 64868).

¿Como puedo liberar espacio y evitar que se llene vuelva a llenar?
Nota: el sistema ubuntu solo se usa para lanzar la máquina virtual, para nada más.

gracias