Complicado decir todo eso, pero por seguridad.
fail2ban para ssh y ftp.
Si quieres firewall gráfico sin complicarte instala webmin y csf/ldf con ldf ya tienes monitoreo y en csf puedes ajustarlo para mayor seguridad.
Anti malware umm si solo tu vas a subir cosas al servidor no creo que te haga mucha falta el anti malware, pero igual puedes chechar por aquí ->
http://www.rfxn.com/projects/linux-malware-detect/