Así es!!
Si utilizas el Flash MX, debes incluir tu "archivo.exe" dentro de una carpeta cuyo nombre sea "fscommand" y luego ejecutas tu acción como la tienes, SIN colocar el nombre de la carpeta en la ruta de acceso al archivo.exe; esto es solo una protección que le colocaron al MX, para evitar algunos problemas de seguridad que se daban con versiones anteriores.
Salu2.