Ya probaste con un diseño adaptable? (responsive design)
Por otro lado yo te recomendaría hacerlo con php por ejemplo.
Código PHP:
Ver original<?php
$uA = $_SERVER['HTTP_USER_AGENT'];
if ( preg_match('/iPhone|iPad|Android|mobil/i', $uA) ) { //Redireccionar a versión mobil
} else {
//Redireccionar a versión normal
}
?>