Se puede optimizar, pero esto te servirá como punto de partida.
Código:
var f = new Date(), mes = f.getMonth()+1, dia = f.getDate(), hora = f.getHours(),minutos = f.getMinutes(), segundos = f.getSeconds();
function anadecero(valor){
if (valor <10) valor = '0' + valor;
return valor
}
document.write(f.getFullYear() + "-" + anadecero(mes) + "-" + anadecero(dia) + " " + anadecero(hora) + ":" + anadecero(minutos) + ":" + anadecero(segundos));
Saludos