Puedes cojer el id de la categoria y utilizarlo en el query que utilizas para mostrar los post populares.
Te mustro como:
<?php
$cat_id = get_query_var('cat');
$popularpost = new WP_Query( array( 'posts_per_page' => 5, 'meta_key' => 'wpb_post_views_count', 'orderby' => 'meta_value_num', 'order' => 'DESC',
'cat' => $cat_id ) );
while ( $popularpost->have_posts() ) : $popularpost->the_post();
?>
<a href="<?php the_permalink(); ?>">
<li>
<div class="info"><span>Featured photo</span><h1><?php the_title(); ?></h1></div>
<div class="mascara"></div>
<div class="imagen"><?php the_post_thumbnail( 'category-thumb' ); ?></div>
</li>
</a>
<?php
endwhile;
?>
Creo que así debería funcionar.