Hack para subir archivos en php

[Nemutagk]

Pueden ser varias las formas, que tengas un formulario que implemente el subir archivos, contraseñas muy sencillas en el FTP o que de plano sea el servidor el que este "infectado", sin mas información es estar adivinando, deberías revisar todos tus formularios, si tienes algún formulario para subir archivos, si usas la función eval() en alguno de ellos, etc,