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[By_George]

Si pero ese es en el inicio antes del while pero despues al final del foreach lo incrementa, se me ocurre algo asi:

Código PHP:

  $result = mysql_query("SELECT MATRICULA,AP_PATERNO,AP_MATERNO,NOMBRE,EMAIL FROM ml_dat_ALUMNO WHERE ID_GRUPO='".$nombre_gpo."' ORDER BY AP_PATERNO ASC "); 
             
    $rowNumber = 2;
    $col = 'A';
    while ($row = mysql_fetch_row($result)) { 
       if($rowNumber==5)//aqui evaluar que si llega a la fila cinco que se inicie de nuevo el valor de $rowNumber y dar valor a $col
       {
             $rowNumber = 2;
       }

       foreach($row as $cell) { 
          $objPHPExcel->getActiveSheet()->setCellValue($col.$rowNumber,$cell); 
          $col++; 
       } 
       $rowNumber++; //Aqui es donde te digo que se incrementa el valor de la variable que controla la fila, que se usa en el for each
    }