Se que ha pasado mucho tiempo de esta pregunta, pero tuve el mismo problema y busqué este Tema, ahora ya me queda claro. Muchas gracias caricatos.
Ah bueno la solución era muy facil;
mi enlace para ejecutar la función era asi:
<a href="#" onclick="funcion()">
entonces para que no ocurra el scrolltop debe ser:
<a href="javascript
:funcion()">
Además agrego que para que la ventana dialog jquery siempre se habra arriba le puedes dar la posición así:
$("#ventana").dialog({
autoOpen: false,
modal: true,
width: ancho,
height:alto,
position: ['top',0],
title:titulo,
buttons: {
"Cerrar": function() {
$(this).dialog("close");
}
}
});
Saludos.