no eso lo tienes que hacer antes de hacer el insert en tu base de datos pro eso se recoje con la vatiable global post y se mete en otra variable para depeus hacer el insert a ese campo con la variable $pwd
seria algo asi
Código PHP:
$pwd=md5($_POST["password"]);
mysql_query("INSERT INTO usuarios(pass) values ('$pwd')") or die(mysql_error());
mysql_close();
PD : perdona sapo pro contestar yo pero es que no vi el fianl te tu mensaje

Un Saludo