Ok, esto parece ser un tema mas general y no específicamente de Java.
Cita:
Iniciado por iivo94 
UTF-16 es como una forma de generalizar la codificacion de los caracteres en las computadoras?
Para ser mas preciso,
fue es un intento para generalizar la codificación de los caracteres.
Cita:
Iniciado por iivo94 es una de las mas usadas no?
No realmente. Cita:
Iniciado por iivo94 no entiendo como hace para relacionarse un numero binario con una letra, osea los numeros binarios siempre van a dar como resultado un numero O NO?
Creo que necesitas aprender como funciona tu computadora. Lo único que hace tu maquina manejar bytes, los caracteres, números impresos en decimal, imagenes, archivos, etc.. son solamente una representación de esos bytes.
Con los encodings pasa lo mismo solamente son una representación de esos bytes. Obviamente tiene su propio protocolo para saber que es que, pero eso varia de encoding a encoding.