No te obceques con los arrays, lo que te han pedido está claro.
Cita: te están pidiendo un array de una estructura (una clase) que contenga los datos que te dicen, nombre y asignaturas con sus notas.
Puedes elegir entre crear dentro de la estructura un array de una clase que contenga asignatura y nota,
Dwalin prácticamente te lo ha dado hecho.