Saludos estimado existen 3 etiquetas que según tu pregunta te servirían:
<header> para lo que tu le llamas encabezado.
<nav> para todo lo que es menú de navegación.
A lo que tu le llamas cuerpo, puedes tomar lo que te dijo C2am y realizarlo con div's, jamás uses tablas para maquetar.
Y por último espero que te sirva, existe una etiqueta <footer> para el pie de página.
Ve en esta pagina todas esas etiquetas, sus atributos y funciones.
http://www.w3schools.com