Hola, no entendí tu pregunta, pero puedes cifrar la contraseña del usuario de la siguiente manera y guardarla en la bbdd:
Código PHP:
$passCifrada = sha1($contraseña);
y para confirmar que la contraseña es correcta en el login:
Código PHP:
if (sha1($str) === $passCifrada)
echo "Correcta";
else
echo "Erronea";
Saludos