No consigo ver la solución a este select

[jurena]

No lo he probado, pero creo que esto te mostrará todas las claves 2 y sus totales, aparezcan o no en tabla1_tiene_tabla2

Código MySQL:

SELECT
  t2.clave2,
  IFNULL(COUNT(t2.clave2),0) total 
 FROM tabla2 t2 
   LEFT JOIN tabla1_tiene_tabla2 t1t2 ON t2.clave2 = t1t2.clave2
  GROUP BY t2.clave2
 

dinos si es así; si no, corregiremos la consulta.