Mientras encuentro una solución más apropiada voy a utilizar esta que se me ha ocurrido:
Miro la posición en que me aparece el ancla del iframe en la pagina principal y estos datos los meto en una función a la que llamo desde el enlace que me lleva a dicho ancla, con esto la pagina principal al pinchar en el enlace me hace scroll hasta esa posición, esto funciona mientras no cambie la posicion, o sea la altura en la que aparece el iframe o la altura en la que aparece el ancla en la pagina del iframe, porque en esos casos tendría que modificar dichos parámetros en todos los enlaces afectados.
Esta es la funcion
scrollPagina(ancho,alto) {
window.scrollTo(ancho,alto)
}
Y este el código del enlace
<li><a onclick="scrollPagina(0,490)" href="Infor01.html" target="contenedor"></a></li>
Ahora necesitaría que los parámetros de alto y ancho en vez de ser fijos variaran en función de la distinta posición que pudiera adoptar el ancla de los distintos enlaces, tomando como referencia, a lo mejor, el id del ancla