Antes debes de generar esa variable, pues no pretendas agregarle una variable en la misma linea donde llamas al script.
<script language="JavaScript">
var my_variable = "funciones.js";
</script>
ahora si podras hacer esto.
<script language="JavaScript" src= my_variable ></script>
![Pensando](http://static.forosdelweb.com/fdwtheme/images/smilies/scratchchin.gif)
lo que no entiendo porque quieres hacer eso, si es mas sencillo llamarlo en forma directa.
Entre gustos y colores ....
Saludos