Pues en el
activacion.php lo único que tendrías que hacer es una consulta de actualización en la tabla cambiando el valor a "confirmado"
WHERE id del usuario sea igual al
id recibido por GET en la dirección -> http:
www.xxxx.com/activacion.php?id=17y654R763fG ...
No tiene demasiado misterio.
Saludos.