Hola El Menda!!!
Resulta que al hacer
te carga por defecto las opciones del kernel 2.4 que no tienen porque ser las mismas que tenia tu kernel 2.2. Asi que aunque tu solo modificastes un par de opciones, puede que de partida ya existieran más diferencias.
Si no recuerdo mal debian tenía el fichero de configuración del kernel 2.2 en /boot/config-2.2.20. Así que yo lo copiaría en /urs/src/linux. Haría un make menuconfig, cargaría el fichero de configuración y ahora, sin tocar nada, volvería a compilar el kernel. Si tras hacer esto todo te vuelve a la vida, ya puedes ponerte a añadir y quitar opciones hasta dejar el kernel a tu gusto.
Suerte,
saludos,
kripton