Es verdad que no puedo crear un objeto dentro de un método de otro objeto?

[chwc]

Mira, tu codigo funciona bien, lo que pasa es que no lo ves, ya que los metodos y variables de un objeto, pueden ser publicos o privados.
con var, declaras a un objeto como privado.
y con this, como publico
prueba con lo siguiente, y veras

Código Javascript:

function PrototipoUno(){
  this.CreateObject = function(){
   this.ObjetoPrueva = new PrototipoDos();
  }
}
 
function PrototipoDos(){
 this.existo = true;
}
 

no tengo mucho tiempo para explicar, pero si declaras el prototipo dentro del constructor ( procura declararlo una sola vez ) este puede acceder a tus datos privados, de otra forma no puede acceder