Como agregar usuario a Samba sin agregarlo a Linux

[caritofa]

Por lo que comentas lo que quieres es agregar usuarios en Linux sin que generen un home directory y después agregarlo en Samba. Para eso tienes que hacer los siguiente:
Ejecutar useradd -s /bin/nologin usuario
De esta manera no generas home directoy ni tendrá acceso al interprete de comandos.
Para comprobarlo puedes hacer un cat /etc/passwd y al final tienes que ver el usuario en el archivo.
Luego para agregarlo a Samba ejecuta el comand smbpasswd -a usuario
Saludos!