Buenas,
Ya ha quedado solucionado. Hay que configurar el FreeTDS para una correcta conexión con el SQL Server de este modo:
- Fichero de configuración /etc/freetds/freetds.conf.
Código:
#SQL Server Connection
[<alias_server_name>]
host = <host>
port = 1433
tds version = 7.0
client charset = UTF-8
Muchas Gracias y espero que ayude al resto de personas.