Como manejar las salidas de un sistema de inventario

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Para el problema que planteas necesitas una tabla de entradas y otra de salidas que se relacionan con artículos por EAN o lo que sea. Además, una tercera tabla con la relación entrada / salida - EAN de manera que cada movieiento del artículo quede registrado. Para operar correctamente con los artículos en esta situación tendrás que trabajar siempre con la tabla que guarda la relación.
Claro que esta es una posibilidad, tendrás que encontrar la solución para tu sistema estudiando que es lo que más te conviene. Salu2