Remplazar archivos de configuración en Linux

[joiscafo]

Hola a todos, tengo una duda y quisiera aprender la forma correcta de hacerlo, respalde los archivos de configuracion de mi proxy, dhcp server, bind9 etc, de un servidor que se encuentra ya funcionando en una usb, ya tengo el nuevo funcionando pero sin la configuracion del otro, cual es la forma correta de de sutituir la configuracion por la ya existente?, es solo copiar y pegar archivos, o que debo de tener en cuenta?.

Espero se entienda mi pregunta y me puedan ayudar gracias.