Puedes generar todo desde el mismo array, si los datos son los que pones en la tabla puedes generar tu array así:
Código PHP:
Ver original $jc = $row[0];
$hora = $row[1];
$num = $row[2];
if (!isset($timeline[$jc])) $timeline[$jc] = array();
$timeline[$jc][$hora] = $num;
}
Saludos.