Has solucionado lo dificil y has pinchado en lo facil :)
Estas abriendo el archivo en modo "w" escritura/sobreescritura, por lo que si el archivo bajo la ruta indicada no existe se crea uno nuevo y si ya existe se abre, pero en ambos casos el puntero de escritura se situa al inicio (es decir que en tu caso el archivo existe y lo sobreescribe) aun cuando hayas movido el puntero de lectura. Intenta abrir en modo adicion/actualizacion "a+" para que el puntero de escritura se situe en el mismo sitio que el de lectura.
En tu otro thread
http://www.forosdelweb.com/f96/c-est...datos-1049446/ ofreces 100.0 USD para solucionar el problema, en este tambien?
Saludos
vosk