Yo estoy seguro que tampoco es por el tipo de tablas MyIsam porque de lo contrario hubiera mostrado el error directamente, sin embargo en mysql verificalo.
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/...on-schema.html
Igual debes verificar con describe que efectivamente los campos que necesitas que busque como
full text(
solo los que vayas a buscar, si no buscas por fecha pues no es necesario) esten bien definidos
http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/es/describe.html
Y por ultimo verifica la estructura de
full text http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/...xt-search.html
Una vez que en mysql logres hacer una busqueda
full text ya te puedes afanar si el problema es de la conexión.
Mi recomendación encarecida es que profundices un poco mas en sql y leas el manual porque todas estas cosas las he aprendido a través de blogs y complemento leyendo lo que dice el manual al respecto.
Cita: la conexion no creo que sea el problema
Cada vez que yo uso esta frase la digo con mucho cuidado, tienes que ir descartando errores para saber que haces mal.