no, déjalo como estaba, sube todos los folders, y asegúrate que la carpeta de cache tenga permisos de escritura.
Cuando lo subas deberia funcionar al entrar a sitio.com/web
despues con htaccess rediriges todas las peticiones a /web con el siguiente htaccess en raiz
Código Apache:
Ver original<IfModule mod_rewrite.c>
RewriteEngine On
RewriteBase /
RewriteRule ^(.*)$ /web/$1 [QSA,L]
</IfModule>
cuentanos como te fue