Pues a lo mejor es que no se saben explicar, si quieres proteger los datos de las transacciones, se usa el certifidado ssl, el cual lo adquieres en el hosting o en alguna empresa que se encargue de estos.
Pasarelas de pago:
paypal.
https://www.paypal.com/es/webapps/mpp/home
2checkout.
mercadopago
westerunion
algun banco.
Empresa para ssl,
https://www.verisign.es/ts-sem-page/...50207760000018
un poco para leer y informarse,
http://es.wikipedia.org/wiki/Pasarela_de_pago
y
http://es.wikipedia.org/wiki/Transport_Layer_Security
tecnologia basada en la criptografia(escrituraoculta),
http://es.wikipedia.org/wiki/Criptograf%C3%ADa
y un poco sobre pasarelas
http://www.cecarm.com/servlet/s.Sl?M...2343&sit=c,732
Y presisamente hace poco un conocido que esta desarrollando un sistema asi con cobros, me dijo que le salia mas barato la comision por medio del banco, ojala te sirva, pero opciones hay muchas, eso si debes de investigar arduamente.
Si eliges un banco, deberas acudir a solicitar informacion alli.
Posdata, el conocimiento es bueno, pero si no se comprarte con claridad no sirve de nada.