en tal caso has de modificar el dom
Cita: <!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD XHTML 1.0 Strict//EN" "http://www.w3.org/TR/xhtml1/DTD/xhtml1-strict.dtd">
<html xmlns="http://www.w3.org/1999/xhtml" lang="es-es">
<head>
<meta http-equiv="content-type" content="text/html; charset=utf-8" />
<title></title>
<script type="text/javascript">
function fnc() {
var bloque = document.getElementById('secc');
var secciones = bloque.getElementsByTagName('div');
for (var i = 0; i < secciones.length; i++) {
var aleatorio = parseInt(Math.floor(Math.random() * secciones.length));
for(var nodo = secciones[aleatorio]; nodo.previousElementSibling; bloque.appendChild(nodo.previousElementSibling));
}
}
window.onload = function() {fnc();};
</script>
</head>
<body>
<div id="secc">
<div>Sección 1</div>
<div>Sección 2</div>
<div>Sección 3</div>
<div>Sección 4</div>
<div>Sección 5</div>
</div>
</body>
</html>