hace bastante creo que mas de un año yo recuerdo haber tenido que trabajar sobre archivos y cree una micro lib
https://github.com/carlosbelisario/FileManager
en su tiempo me sirvió, la clase principal fue esta
https://github.com/carlosbelisario/F...ileManager.php
recuerdo que lo actualizaba y todo, pero tengo tiempo sin tocarla, lo que no le hice fue autoload por flojera no tiene otro nombre pero me sirvio en el momento verifica a ver si te sirve para lo que quieres, porque creo que me perdí un poco en tu problema, saludos