Primer día de Linux y ni idea

[telele]

Hola, he comenzado a usar Debian por primera vez y estoy probando cosas de los tutoriales para aprender.En esas estoy y me he dado cuenta de una cosa: cuando miro "normal" en una carpeta veo que hay un archivo que llamé prueba.xml. Cuando hago ls -l en la consola salen todos los archivos de esa carpeta menos el prueba.xml y si quiero hacer de prueba un programa que cargue ese archivo introduciendo su nombre por teclado, pues claro, no lo encuentra. ¿A qué se debe? Gracias por vuestra paciencia y ayuda en mi primer día Linuxero :)