Pues se me ocurre que puede que el disco duro esté calentándose demasiado... y ese es el motivo de que desaparezcan las particiones.
Ponte algún programa que mida la temperatura de tus discos como por ejemplo, disk Alarm, [URL="http://es.download.cnet.com/DiskAlarm/3000-2094_4-75327189.html?tag=mncol;1"]http://es.download.cnet.com/DiskAlarm/3000-2094_4-75327189.html?tag=mncol;1[/URL]y mira a ver si es cuando se calienta demasiado es cuando se reinicia...
Ya nos cuentas que tal te fué...