Cita:
Iniciado por xaviercarrera23 
¿Has resuelto algo fuera de este foro?
Yo sigo investigando...
No, no he resuelto nada. Pero:
1.- Por tus explicaciones parece que en Prezi sólo puedan incluirse gráficos vectoriales en swf. Lo aclaro para que nadie se confunda: se pueden incluir PDFs y funcionan perfectamente aunque, óbviamente, sin animación y sin transparencia (esta última, la razón por la que empecé este tema).
2.- Una vez tuve que incluir en Prezi una animación y creo recordar que para crear el swf animado utilicé Hamster Video Converter (gratuito) para convertir desde un formato de video cualquiera. Lo único que me pasó es que tuve que crear el video a muchas imágenes por segundo (no recuerdo exáctamente, pero digamos que 60). Prezi no parece tener en cuenta la velocidad de reproduccion que especifique el archivo insertado.
3.- El uso de pngs de alta resolución me está dando bastante buenos resultados. Aunque sólo funciona si el rango de zooms no es muy grande.
4.- Yo no confiaría en que
pronto lo arreglen. Recuerdo que en su momento estuve leyendo en el propio foro de Prezi al respecto y hace como mínimo dos años que alguien ya les planteó el problema (aunque hablo de memoria y podría hacer incluso bastante más tiempo).