En zf2 el tool no es parte de la distribución estándar, es un modulo a parte,
ZFTool, el cual tienes que instalar y activar(o bajar el .phar), ten en cuenta que no tiene las mismas capacidades que el de la versión 1.x
https://github.com/zendframework/ZFTool#usage.
Para empezar a trabajar con zf2 lo mas sencillo es clonar el
skeleton
Saludos.