No sé si estoy en lo cierto, pero.. el problema.. es que te parpadea la pantalla.. o que la CPU se pone en picos del 100%?
La CPU es normal que se ponga en picos del 100% sobretodo cuando lo enciendes, ya que... para explicarlo como si la CPU fuera una persona... a la que le faltan 5 minutos para irse a casa despues de trabajar...
Si tiene faena para realizar... lo hace empleando el 100% de sus posibilidades como consecuencia, hace las cosas antes, sobretodo si procesa poca información, y eso es lo que hace la CPU siempre,... si tiene faena.. se pone al maximo de su rendimiento, y cuando ya no tiene, se relaja de ahí que suba y bajen los picos del rendimiento.
En pocas palabras, es normal un grafico en el que suben y bajan en picos en torno a los que mencionas,... claro está que si dijeras que la media... es estar siempre a full.. sin hacer nada... pues... entonces si que debe haber algún virus creando algún bucle y ocasionando un trabajo constante de la CPU.
Ahora bien.. si tu pantalla parpadea,.. puede deberse a la tarjeta grafica, al cable.. que tenga algún hilo roto, o a la misma pantalla. :)
Espero haberte ayudado!