Hola:
Las áreas parece que están bien... te comento la teoría:
el mapa se aplica a una imagen totalmente transparente, pero detrás y en la misma posición (x, y) se encuentra visible una imagen sin color (o el color de fondo que prefieras), y encima se colocan con las mismas coordenadas (x=0, y=0) el resto de imágenes de las provincias. Es fundamental que todas se superpongan...
Muéstranos algunas de las imágenes (si tienes un enlace provisionalm mejor.
Saludos