Debes saber que para eso sirve el atributo
value de cada <option/>, si necesitas pasar un valor especifico (diferente al que se lee) debes usar dicho atributo.
Así como lo haces no tiene mucho sentido, ya que en el value asignas el mismo valor que se lee y eso es un desperdicio.
Primero debes seleccionar ambas columnas.
Cita: SELECT opcion, relacion FROM ...
Luego usar la relación como value.
Código PHP:
echo "<option value='".$depto['relacion']."'>".$depto['opcion']."</option>";
Así, al recibir no obtienes el texto de las opciones sino el valor definido en los atributos value.
Y así es como funcionan las cosas cuando se hacen bien, no hace falta que te inventes nada adicional.
Ahora que si lo piensas no necesitas pasar dos valores, con únicamente pasar la relación puedes hacer un SELECT donde recibe sel valor y ahí obtener cualquier otro dato adicional.