Con lo que expliqué arriba ya depende de vos como quieras hacerlo o que quieras lograr, es solo un tema de lógica y que armes una estructura como te quede más cómoda, ya sea creando un "gran" .fla nuevo que cargue los otros .swf adentro y/o usar embebidos todo en un mismo html y/o en distintos html, con respecto a usar
iframes para cargar html dentro de html no es lo más usado, saludos
