Consulta clientes con compras todos los meses

[gnzsoloyo]

Volvamos al principio:

Código MySQL:

SELECT nombre 
FROM clientes c 
WHERE clatip=2 
AND clacli IN (
    SELECT clacli 
    FROM factura 
    WHERE month(fecha) IN(1, 2, 3) AND year(fecha)=2012);
 

Creo que es más simple...

La otra está simplemente mal, porque intentas comparar un sólo campo, contra dos campos, y eso es incorrecto.
Esa consulta debes er replanteada, y te sugiero obtenerla usando JOINs.