Bueno la forma mas sencilla creo que seria leer linea por linea tu archivo de las urls
Código PHP:
<?php
$file = fopen("URLS.txt", "r") or exit("NO SE PUDO ABRIR :/");
$emails = array();
while(!feof($file))
{
$text = file_get_contents( fgets( $file ) );
$res = preg_match_all("/[a-z0-9]+([_\\.-][a-z0-9]+)*@([a-z0-9]+([\.-][a-z0-9]+)*)+\\.[a-z]{2,}/i",$text,$matches);
if ($res)
{
foreach(array_unique($matches[0]) as $email)
{
$emails[] = $email;
}
}else{
$emails[] = "No hay emails";
}
}
fclose($file);
echo '<table>';
foreach($emails as $email)
{
echo '<tr><td>'.$email.'</td></tr>';
}
echo '</table>';
?>